計算の流れ

計算の流れを下図に示します。

具体的には、計算初期段階での速度の規格化等、その他色々と考えなくてはいけない項目がありますが、全体としてはこのような流れです。続いて、初期状態の原子配置を与えるプロセスを考えます。